Рыбное хозяйство — это деятельность, которая начала оказывать негативное воздействие на африканскую экологию в последние годы. Инвазивные виды, внедряемые предприятиями аквакультуры, меняют экосистему таких мест, как дельта Окаванго, озеро Малави и озеро Виктория.
Рыбное хозяйство было введено в Африку предыдущими колониальными властями в качестве способа улучшения производства в области рыболовства и учета потребностей растущего населения. Однако экономический рост не всегда резонирует с подходящими продуманными методами и экологическим благополучием. Хотя рыбоводческие хозяйства производят большое количество товаров для удовлетворения потребностей населения, их владельцы, как правило, не заботятся об экологическом благополучии. Эти фермы действительно способствуют благополучию общин, но нельзя игнорировать негативную сторону бизнеса. Повышение осведомленности о вредной стороне производства определенных видов рыб должно быть приоритетом в этой области.
Говорят, что некоторые виды рыбы растут быстрее, чем другие, но, по словам специалистов, «нет никаких доказательств того, что нильская тилапия будет расти быстрее или будет иметь лучшую эффективность конверсии пищи, чем местные виды тилапии, если их производить в тех же условиях». Адриан Пирс — консультант по аквакультуре — представил красноклешневого рака африканской аквакультуре более 20 лет назад. Новый вид оказался инвазивным и вредным для местной экосистемы. Новые инвесторы по-прежнему приносят потенциально вредные виды. Угроза разведения таких видов недооценивается и игнорируется предпринимателями.
Продвижение неадекватной аквакультуры и внедрение иноземных видов являются разрушительными для эндемичных рыб. До сих пор наиболее инвазивными видами были нильская тилапия и нильский окунь. Нильская тилапия вызывает экологическую проблему, подавляя другие виды. Она размножается, и все виды тилапии вокруг нее «загрязняют» свой генофонд и, в конечном итоге, нильская тилапия просто уничтожает их. По словам рыбаков и ихтиологов, нильская тилапия ставит под угрозу существование карибской тилапии, которая является видом, характерным для южных берегов Африки и озера Кариба.
Небольшое количество водных биологов и природоохранных организаций думает о способах снижения вредного воздействия таких инвазивных видов на африканскую экосистему путем строительства водосливов и заграждений для рыбоводных прудов, созданных внутри страны. Однако критики скептически относятся к этим методам, утверждая, что они ненадежны.
